Javier est un baron de la drogue puissant et influent, qui contrôle une grande partie de la jungle d'un petit pays d'Amérique du sud. L'argent de la drogue lui permet d'entretenir sa propre armée privée. C'est un criminel recherché dans plusieurs pays, et un homme particulièrement cruel. Lorsque les services secrets apprennent qu'un ex-chercheur d'Umbrella s'est rendu dans cette région, le gouvernement américain décide d'envoyer Leon et Krauser sur place pour déterminer ce qui s'y passe, afin d'éviter tout nouvel incident biologique.